Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Col5a3Q9JLI2 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Col5a3Q9JLI2 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Col5a3Q9JLI2 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Col5a3Q9JLI2 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Col5a3Q9JLI2 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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Col5a3Q9JLI2 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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Col5a3Q9JLI2 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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