Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Usp29Q9ES63 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Usp29Q9ES63 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Usp29Q9ES63 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Usp29Q9ES63 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp29Q9ES63 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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