Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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