Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ttc39dQ0VF76 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms