Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PtprtQ99M80 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PtprtQ99M80 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PtprtQ99M80 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PtprtQ99M80 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprtQ99M80 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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