Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Znf48Q3US17 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Znf48Q3US17 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Znf48Q3US17 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Znf48Q3US17 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Znf48Q3US17 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Znf48Q3US17 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Znf48Q3US17 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Znf48Q3US17 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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