Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SbdsP70122 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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