Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc18Q640L5 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms