Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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Usp48Q3V0C5 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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Usp48Q3V0C5 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Usp48Q3V0C5 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Usp48Q3V0C5 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Usp48Q3V0C5 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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