Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cntn3Q07409 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Cntn3Q07409 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Cntn3Q07409 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Cntn3Q07409 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Cntn3Q07409 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Cntn3Q07409 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Cntn3Q07409 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Cntn3Q07409 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cntn3Q07409 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms