Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cpne9Q1RLL3 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms