Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Hoxd10P28359 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Hoxd10P28359 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Hoxd10P28359 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Hoxd10P28359 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Hoxd10P28359 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Hoxd10P28359 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Hoxd10P28359 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Hoxd10P28359 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd10P28359 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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