Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Snx27Q3UHD6 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Snx27Q3UHD6 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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