Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RxraP28700 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms