Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer3W4VSP1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms