Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc166S4R181 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc166S4R181 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms