Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I9

Sucla2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sucla2Q9Z2I9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sucla2Q9Z2I9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sucla2Q9Z2I9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms