Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxankQ9Z205 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms