Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ChrdQ9Z0E2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChrdQ9Z0E2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms