Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin2Q9WVE8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms