Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clcn5Q9WVD4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clcn5Q9WVD4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms