Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sorbs3Q9R1Z8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms