Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx6Q9R1R0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms