Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms