Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod1Q9R0E2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms