Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms