Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg1Q9QZE5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms