Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Kcnip3Q9QXT8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Kcnip3Q9QXT8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms