Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms