Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim44Q9QXA7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms