Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer2Q9QWW1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms