Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mid2Q9QUS6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms