Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma6Q9QUM9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms