Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms