Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms