Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin3Q9JLB9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms