Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms