Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms