Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms