Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbr1Q9JIT0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms