Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI18

Lrp1b, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp1bQ9JI18 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrp1bQ9JI18 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrp1bQ9JI18 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms