Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1Q9ESG2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1Q9ESG2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms