Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms