Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn1Q9EPL2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn1Q9EPL2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms