Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms