Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Xab2Q9DCD2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xab2Q9DCD2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms