Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med27Q9DB40 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms