Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pop5Q9DB28 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms