Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb1Q9DAK3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms