Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhc1Q9D9T8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms